肛瘘的诊断检查方法包括以下几种：

1. 肛门直肠镜检查：这是一种常用的检查方法，可以通过直肠镜进入肛门，观察肛门内部情况，并且可以清晰地看到肛门内部的情况。

2. 肛门直肠指诊：医生通过手指在肛门周围进行触诊，可以判断是否存在肛瘘。

3. 血液检查：如果患者出现便血、腹泻等症状，医生可能会建议进行血液检查，以确定是否存在炎症或感染。

4. CT扫描：CT扫描可以帮助医生更好地了解肛门周围的结构和病变情况，从而更准确地判断是否存在肛瘘。

5. MRI检查：MRI检查可以更清晰地显示出肛门周围的结构和病变情况，有助于医生做出准确的诊断。

需要注意的是，这些检查方法都有其适用范围和局限性，医生需要根据患者的具体情况选择合适的检查方法。同时，患者也应该积极配合医生进行治疗和复诊。