巧克力囊肿是由于子宫内膜细胞在孕期或分娩后异常增生形成的。具体来说，这种情况发生的原因可能有以下几个方面：

1. 遗传因素：一些人天生就容易出现子宫内膜异位症，包括巧克力囊肿。

2. 月经周期不规律：如果月经周期不规律，可能会导致子宫内膜细胞异常增生。

3. 孕期压力过大：孕妇在怀孕期间可能会感到压力和焦虑，这也可能会导致子宫内膜异位症的发生。

4. 营养不良：营养不良也可能导致子宫内膜异位症的发生。

5. 疾病或药物：某些疾病或药物使用也可能导致子宫内膜异位症的发生。

总之，巧克力囊肿的形成是由多种因素综合作用引起的。如果您有相关症状，建议及时就医进行诊断和治疗。