多种病毒可以导致手足口病。其中，柯萨奇病毒A16型最为常见，另外柯萨奇病毒A的其他亚型以及肠道病毒71型也能引发手足口病。肠道病毒是一类病毒，包括脊髓灰质炎病毒、柯萨奇病毒和埃可病毒。这些病毒感染的部位涵盖整个消化道，从口腔到肠道，通过污染的食物、饮料以及水果等进入体内，然后在肠道内繁殖。

手足口病主要发生在10岁以下的儿童，但也有成人可能感染，因此可以说几乎每个人都有感染的风险。一旦感染，人体只会对感染的特定型别病毒产生免疫力，而不会对其他型别的病毒产生交叉免疫，这意味着即使曾经患有手足口病，也可能再次感染其他型别的病毒而患上手足口病。

手足口病的传播方式主要是通过粪口途径，而非呼吸道，感染部位涵盖咽喉和整个消化道。这种疾病通常是由食用或饮用被污染的食物、水果和饮料引起的，而不是通过呼吸在拥挤的人群中传播。

病毒在常温下可以存活数日，但在50℃下迅速被灭活，煮沸的水中也不会存活。因此，在手足口病流行期间，主要预防措施是注意食用熟食和新鲜食品。肠道病毒是人类最常见、最重要的病毒之一，其主要感染部位在消化道而不是呼吸道。由于病毒感染引起的症状可能与胃肠型感冒、不明原因发热、流行性胸痛、病毒性脑炎、病毒性心肌炎等相似，因此常常被误诊。在治疗上，通常只进行对症处理。

儿童和成人都有可能感染手足口病，尤其是5岁以下的儿童更容易感染。环境卫生差、个人卫生习惯不良是诱发手足口病和病毒性咽峡炎的常见因素。