大姨妈来的时候腰疼可能是多种原因引起的。以下是一些可能的原因：

1. 子宫收缩：大姨妈期间，子宫会收缩以帮助子宫内膜脱落。这种收缩可能会引起腰部肌肉的疼痛。

2. 子宫内膜异位症：子宫内膜异位症是一种疾病，其中子宫内膜在子宫内膜以外的部位生长。这可能会导致子宫收缩时的疼痛，包括腰部疼痛。

3. 盆腔炎：盆腔炎是一种感染，可能导致子宫和子宫周围的炎症。这可能会引起腰部疼痛。

4. 子宫肌瘤：子宫肌瘤是一种良性肿瘤，可能导致子宫增大，从而引起腰部疼痛。

5. 子宫内膜异位囊肿：子宫内膜异位囊肿是一种囊肿，其中子宫内膜生长在子宫外的部位。这可能会导致子宫收缩时的疼痛，包括腰部疼痛。

如果你有腰疼的症状，建议咨询医生进行详细的检查和诊断。医生可能会进行妇科检查、血液检查和可能的影像学检查（如B超）来确定具体的原因。