大姨妈来的时候腰疼可能是多种原因引起的，以下是一些可能的解释：

1. 子宫收缩：大姨妈期间，子宫会收缩以帮助血液排出，这可能会导致腰部疼痛。这种疼痛通常是轻微的，并且通常在大姨妈结束后会消失。

2. 子宫内膜异位症：如果子宫内膜在子宫外生长，可能会导致疼痛，包括腰疼。这种疼痛通常是严重的，并且可能需要治疗。

3. 盆腔炎：盆腔炎是一种感染，可能导致腰疼和其他症状。这种疼痛通常是严重的，并且可能需要抗生素治疗。

4. 子宫肌瘤：如果子宫里有肌瘤，可能会导致腰疼。这种疼痛通常是轻微的，并且可能需要进一步检查来确定肌瘤的性质。

5. 子宫内膜异位囊肿：如果子宫内膜在子宫内形成了囊肿，可能会导致腰疼。这种疼痛通常是轻微的，并且可能需要进一步检查来确定囊肿的性质。

如果你的腰疼持续存在，建议你咨询医生以获得更准确的诊断和治疗建议。