正常情况下，子宫内膜覆盖在子宫体腔面，但由于某些原因，导致子宫内膜在身体其他部位生长，形成子宫内膜异位症。这种异位的内膜不仅在组织学上具有内膜的腺体，还有内膜间质包围；在功能上，它随着雌激素水平的变化而发生显著变化，即随着月经周期的变化，但只有部分受孕激素的影响，才能产生少量的“月经”，引起各种临床现象。

子宫内膜异位症是否导致不孕呢？答案是肯定的，而且不孕的发生率相当高。子宫内膜异位引起不孕的最简单原因是它可能导致子宫后位粘连，活动受限；还可能导致输卵管粘连，使得输卵管的蠕动减弱。在严重的情况下，子宫内膜异位可能导致输卵管阻塞，从而限制精子和卵子的运动，影响受精和孕卵的迁移过程。

当子宫内膜异位发生在卵巢时，较大的巧克力囊肿等可能会影响卵巢的功能。科学家近年来认为，子宫内膜异位症引起不孕的机制不仅仅是机械性原因，还涉及免疫学和内分泌学的因素。异位的子宫内膜被视为一种自身抗原，可能引起女性免疫系统的亢进，例如产生抗子宫内膜的抗体，从而增加淋巴细胞和巨噬细胞等。抗子宫内膜的抗体可能导致大量的巨噬细胞吞噬精子，从而不利于受孕。

内分泌因素也是子宫内膜异位症引起不孕的一个重要原因，主要与前列腺素的分泌有关。研究已经证实，异位的子宫内膜可以产生大量的前列腺素。这种激素对子宫和输卵管的平滑肌具有强烈的收缩作用，破坏了输卵管正常的蠕动和子宫的“安静”状态，从而干扰了精子、卵子在生殖道中的运动以及孕卵的着床，最终导致不孕。