晚期鼻咽癌的质子治疗费用因地区、医院和治疗方案的不同而有所差异。一般来说，质子治疗的费用通常比传统的放疗治疗更高。以下是一些可能影响质子治疗费用的因素：

1. 地理位置：不同地区的医疗资源、物价水平和医保政策都可能影响治疗费用。

2. 医院选择：不同医院的设备、技术水平和服务质量也可能影响治疗费用。

3. 治疗方案：不同的治疗方案可能需要不同的设备、材料和人力投入，从而影响治疗费用。

4. 医保覆盖：不同地区的医保政策可能对治疗费用的报销额度和比例有所不同。

具体的治疗费用可以通过咨询当地的医疗机构或保险公司来获取。一般来说，质子治疗的费用通常在数十万到数百万元人民币之间。建议患者在决定治疗方案前，了解当地的医疗资源和保险政策，以便做出明智的财务决策。