病因不明。有70%的患者患有慢性输卵管炎，而50%有不孕史。经过病理检查，发现单侧输卵管癌患者的对侧输卵管经常有炎性改变，因此推测长期的炎症刺激可能是发病的原因之一。尽管慢性输卵管炎很常见，但输卵管癌却很罕见，因此炎症并不是唯一的诱因。

输卵管肿瘤可以分为良性和恶性两种。良性肿瘤在输卵管中很少见，多来自于副中肾管或中肾管。凡是可以在子宫内发生的肿瘤都可以在输卵管中发生，所以种类很多。其中腺瘤样瘤相对较常见，其他如乳头状瘤、血管瘤、平滑肌瘤、脂肪瘤、畸胎瘤等非常罕见。由于肿瘤体积小，通常没有症状。因此，在手术前很难诊断，但预后良好。

恶性肿瘤可以分为原发性和继发性两种。绝大多数输卵管恶性肿瘤是继发性癌症，占据了80%至90%的比例，通常是由卵巢癌转移而来，其次是子宫内膜癌，还可以来自对侧输卵管或者是乳腺、胃肠道的癌症。Finn等人报告了33例转移性输卵管癌，其中原发癌症分别来自卵巢（20/33）、子宫（11/33）、对侧输卵管（1/33）和直肠（1/33）。然而，子宫颈癌很少会转移到输卵管。