同房时肚子疼可能有多种原因，以下是一些可能的解释：

1. 生理原因：同房时，子宫和直肠的肌肉会收缩，这可能会导致肚子疼。这种疼痛通常比较轻微，不会持续很长时间。

2. 妇科问题：一些妇科问题也可能导致同房时肚子疼，比如子宫内膜异位症、子宫肌瘤、子宫脱垂等。这些问题可能会引起疼痛、出血、性交困难等症状。

3. 感染：同房时，如果一方患有性传播感染，如淋病、衣原体感染等，也可能导致肚子疼。这些感染可能会引起疼痛、瘙痒、分泌物异常等症状。

4. 其他原因：其他一些原因也可能导致同房时肚子疼，比如消化问题（如胃痛、消化不良）、泌尿系统问题（如膀胱炎、尿道感染）等。

如果你经常出现同房时肚子疼的情况，建议尽快就医，进行详细的妇科检查和必要的检查，以确定具体的原因。