自然流产是一种常见的妊娠期并发症，通常发生在妊娠12周之前。判断自然流产是否流干净，可以通过以下几个方面进行评估：

1. 出血情况：自然流产后，通常会有少量的阴道出血，出血量和持续时间因人而异。如果出血量过多、持续时间过长，或者伴有其他异常出血情况，可能提示流产不全。

2. 组织排出情况：自然流产后，子宫内膜和胎儿组织会排出体外。如果排出物较多、颜色较深，可能提示流产不全。

3. 子宫收缩情况：自然流产后，子宫通常会收缩，以帮助排出残留的组织。如果子宫收缩不协调或不完全，可能提示流产不全。

4. 临床检查：医生可能会进行妇科检查，包括阴道检查、子宫颈检查和子宫内膜刮取等，以确定子宫内是否有残留的组织。

如果怀疑自然流产不全，建议及时就医，接受进一步的检查和治疗。医生可能会建议进行药物治疗、手术治疗或观察等待，具体治疗方案应根据病情和医生的建议来确定。