自然流产后，判断是否留干净是一个重要的问题。以下是一些可能有助于判断留不干净的因素：

1. 出血情况：自然流产后，出血是常见的症状。出血量和持续时间因个体而异。如果出血过多或持续时间过长，可能需要进一步检查。

2. 子宫收缩：自然流产后，子宫需要收缩以排出残留的组织。子宫收缩的疼痛可能是一个提示，表明子宫正在收缩。

3. 子宫内膜厚度：自然流产后，子宫内膜厚度通常会逐渐减少。如果子宫内膜厚度没有按照预期减少，可能需要进一步检查。

4. 阴道分泌物：自然流产后，阴道分泌物可能会增多。如果分泌物中存在血迹或组织碎片，可能需要进一步检查。

5. 妇科检查：医生可能会进行妇科检查，以检查子宫内是否有残留的组织。这可能包括子宫内膜厚度测量、子宫颈检查和阴道分泌物检查。

如果怀疑自然流产后留不干净，建议咨询医生进行进一步检查和评估。医生会根据具体情况制定适当的治疗方案。