扁桃体发炎手术后遗症可能包括：

1. 疼痛：手术后可能会出现疼痛，可能是手术切口愈合引起的疼痛，也可能是手术后炎症引起的疼痛。

2. 吞咽困难：手术后可能会出现吞咽困难，可能是手术切口愈合引起的疼痛，也可能是手术后炎症引起的疼痛。

3. 声音嘶哑：手术后可能会出现声音嘶哑，可能是手术切口愈合引起的疼痛，也可能是手术后炎症引起的疼痛。

4. 发热：手术后可能会出现发热，可能是手术后炎症引起的。

5. 喉咙不适：手术后可能会出现喉咙不适，可能是手术后炎症引起的。

6. 咳嗽：手术后可能会出现咳嗽，可能是手术后炎症引起的。

如果手术后出现这些症状，建议及时就医，以便医生进行进一步的评估和治疗。手术后的康复期因个体差异而异，一般需要数周至数月的时间。在康复期间，保持良好的饮食和休息习惯，避免吸烟和饮酒，有助于促进伤口愈合和康复。