尿结石碎石后仍然疼痛可能是由于以下几个原因：

1. 残留结石：碎石手术可能无法完全清除所有结石，残留的结石可能会引起疼痛。

2. 感染：碎石手术可能会导致尿道或肾脏的感染，这可能会引起疼痛。

3. 术后疼痛反应：每个人对疼痛的敏感度和反应不同，有些人可能对碎石后的疼痛反应更强烈。

4. 术后恢复：碎石手术可能需要一段时间的恢复，这段时间内可能会出现疼痛。

如果你在碎石手术后仍然感到疼痛，建议尽快就医，以便医生进行进一步的检查和治疗。医生可能会进行尿路造影或超声检查，以确定残留结石的存在，并采取相应的治疗措施。