龋齿疾病的主要病因包括以下几个方面：

1. 细菌感染：龋齿的主要致病菌是变形链球菌和乳酸杆菌。这些细菌在口腔内形成牙菌斑，通过分解食物残渣和碳水化合物产生酸性物质，从而腐蚀牙齿。

2. 糖的摄入：龋齿的发生与糖的摄入密切相关。高糖饮食会导致口腔内酸性物质的产生，从而促进龋齿的发展。

3. 牙齿的结构：牙齿的结构也是龋齿发生的一个重要因素。牙齿的结构使得牙齿表面容易形成菌斑，从而增加了龋齿的风险。

4. 牙齿的清洁：牙齿的清洁也是预防龋齿的重要措施。定期刷牙、使用牙线和漱口水可以清除牙齿表面的细菌和食物残渣，从而减少龋齿的发生。

5. 遗传因素：研究发现，龋齿的发生与遗传因素有一定的关联。一些研究表明，某些基因可能与龋齿的发生有关，但具体的遗传机制尚不明确。

总之，龋齿疾病的主要病因包括细菌感染、糖的摄入、牙齿的结构、牙齿的清洁和遗传因素。预防龋齿的关键是保持良好的口腔卫生习惯，定期进行口腔检查和治疗。