肛瘘是指肛门周围的结构受到感染或创伤，形成一个通道，从肛门内部或外部通向直肠或肛门外部。其病理变化主要包括以下几个方面：

1. 炎症反应：肛瘘的形成通常是由于肛门周围的皮肤和黏膜受到感染或创伤而引起的。在炎症反应期间，细菌和其他微生物会侵入伤口并进入直肠或肛门内部。

2. 组织损伤：当炎症反应发展到一定程度时，组织也会受到损伤。这可能导致肠壁、黏膜和淋巴管等组织出现破裂、脱落和溃疡等病变。

3. 脓液积聚：在肛瘘形成过程中，由于感染和炎症反应，脓液会在肛门周围积聚并形成脓液囊。这些脓液囊可能会逐渐增大并破裂，导致感染扩散到其他部位。

4. 瘘管形成：当脓液囊积聚到一定程度时，它们会形成一个通道，从肛门内部或外部通向直肠或肛门外部。这个通道被称为瘘管。

5. 瘘管扩张：随着时间的推移，瘘管可能会继续扩张并进一步影响周围的组织。这可能导致疼痛、排便困难、腹泻等症状。

总之，肛瘘的病理变化主要是由于感染和炎症反应引起的组织损伤和脓液积聚所导致的。治疗肛瘘需要根据具体情况制定相应的治疗方案，包括手术切除瘘管、使用抗生素等药物治疗等。