卵巢囊肿合并妊娠的最佳治疗时间取决于囊肿的性质、大小和患者的具体情况。一般来说，卵巢囊肿在妊娠早期（12周以内）可能不需要特殊治疗，但如果囊肿较大或伴有其他并发症，可能需要手术治疗。

在妊娠中期（12-24周），如果囊肿较大或伴有其他并发症，可能需要手术治疗。手术治疗的目的是保护母体和胎儿的安全，并尽可能保留卵巢组织。

在妊娠晚期（24周以后），囊肿的治疗可能需要更加谨慎。如果囊肿没有引起其他并发症，可能不需要特殊治疗。但如果囊肿较大或伴有其他并发症，可能需要手术治疗。

总之，卵巢囊肿合并妊娠的治疗时间取决于囊肿的性质、大小和患者的具体情况。建议在妊娠早期和中期进行定期检查，以便及时发现和处理任何并发症。如果需要治疗，最好在妊娠中期进行手术治疗，以确保母体和胎儿的安全。