慢性咽炎是一种常见的慢性炎症疾病，其难以根治的原因主要有以下几个方面：

1. 病因复杂：慢性咽炎的病因多种多样，包括细菌、病毒、真菌、过敏等。不同的病因可能需要不同的治疗方法，因此根治慢性咽炎需要针对具体的病因进行治疗。

2. 炎症反应：慢性咽炎是一种慢性炎症疾病，炎症反应是慢性咽炎的主要特征之一。炎症反应会导致咽部黏膜的慢性炎症和增生，使得炎症难以完全消除。

3. 免疫功能：慢性咽炎与免疫功能有关，免疫功能异常可能导致慢性炎症反应的持续存在。因此，提高免疫功能对于根治慢性咽炎也是非常重要的。

4. 生活习惯：慢性咽炎与生活习惯有关，如吸烟、饮酒、辛辣食物等。这些不良生活习惯可能导致慢性咽炎的复发，因此改善生活习惯也是根治慢性咽炎的重要措施。

5. 药物治疗：慢性咽炎的治疗主要包括药物治疗和手术治疗。药物治疗包括抗生素、抗病毒药物、抗炎药物等，但药物治疗的效果因人而异，而且长期使用药物也可能产生耐药性。

总之，慢性咽炎难以根治的原因是多方面的，需要针对具体的病因和症状进行综合治疗。同时，改善生活习惯、提高免疫功能也是根治慢性咽炎的重要措施。