先天性巨结肠的常见诊断方法包括：

1. 体格检查：医生可以通过触摸腹部、观察肛门周围是否有肿胀、肿块等来初步判断是否存在先天性巨结肠。

2. 直肠指检：医生使用手指插入肛门，检查直肠和肛门周围的情况，包括是否有异常的肿块、狭窄等。

3. 影像学检查：包括X线检查、CT扫描和MRI等。这些检查可以提供详细的图像，帮助医生确定巨结肠的位置、大小和形态等。

4. 结肠镜检查：医生使用一根细长的管道，插入肛门，通过观察管道内的图像，可以直接观察结肠内部情况，包括巨结肠的位置、大小和形态等。

5. 直肠肛门测压：医生通过在肛门周围放置压力传感器，记录肛门括约肌的收缩和松弛情况，有助于判断巨结肠的存在和严重程度。

6. 粪便分析：医生可以通过收集患者的粪便样本，进行粪便分析，包括粪便成分、颜色、形态等，有助于判断巨结肠的存在和严重程度。

这些诊断方法可以综合使用，以提供更全面、准确的先天性巨结肠的诊断信息。