治疗先天性巨结肠的最新手术方法主要包括以下几种：

1. 肠切除术：这是最常用的手术方法，通过切除部分或全部肠道来缓解巨结肠的症状。具体手术方法包括全结肠切除术、部分结肠切除术和回肠转位术等。

2. 肠道重建术：这种手术方法主要用于治疗巨结肠患者，通过重建肠道功能来缓解症状。具体方法包括回肠造瘘术、回肠-空肠吻合术和回肠-结肠吻合术等。

3. 肠道支架植入术：这种手术方法主要用于治疗巨结肠患者，通过植入支架来改善肠道功能。具体方法包括小肠支架植入术和结肠支架植入术等。

4. 肠道移植术：这种手术方法主要用于治疗严重巨结肠患者，通过移植健康的肠道来替代受损的肠道。具体方法包括肠道移植术和肠道移植联合肠切除术等。

治疗先天性巨结肠的手术方法不断发展和改进，医生会根据患者的具体情况选择最合适的手术方法，以达到最佳的治疗效果。