1. 目前认为遗传因素是肥厚型心肌病的主要病因。该观点的支持包括病例中明显存在家族性发病倾向，且常伴随其他先天性心血管畸形。有些患者甚至在出生时就表现出病症，而且在肥厚型心肌病患者中可观察到HLA抗原的遗传基因型。家族性病例通常以常染色体显性遗传形式传递，导致不对称性心肌肥厚的无症状型式，或者出现典型的梗阻症状。约50%～55%的肥厚型心肌病患者有家族史，这表明它属于常染色体显性遗传病。肥厚型心肌病的遗传学机制已被公认，并与组织相容抗原系统密切相关。肥厚型心肌病患者HLA-DRW4、Ag、B5抗原的检出率明显增加。1995年，世界卫生组织和国际心脏协会明确指出，家族性肥厚型心肌病是由肌节收缩蛋白基因突变引起的。遗传缺陷可能通过多种机制引发疾病，包括儿茶酚胺与交感神经系统异常、室间隔不成比例的胎儿期增厚、房室传导过速、原发性胶原异常、心肌蛋白合成异常、小冠状动脉异常等。

2. 临床研究和实验证明，肥厚型心肌病患者存在钙调节紊乱，尤其是心肌细胞内钙浓度升高与心室舒张功能有关。Wagner等的研究发现，肥厚型心肌病患者心肌细胞内钙离子受体数量增加，反映电压依赖性钙离子通道密度增高。这种现象不仅存在于肥厚的室间隔，而且存在于厚度正常的右心房心肌，提示受体的增加并非继发性改变，而是一种原发性缺陷。