生殖器疱疹是一种由单纯疱疹病毒（HSV）引起的性传播疾病。久治不愈的原因可能有以下几种：

1. 病毒潜伏：HSV病毒在感染后，一部分病毒会进入潜伏状态，潜伏的病毒难以被清除，导致复发。

2. 免疫抑制：某些疾病或药物可能导致免疫系统功能下降，使得病毒难以被完全清除，导致久治不愈。

3. 病毒变异：病毒在感染过程中可能会发生变异，使得治疗药物对病毒的敏感性降低，导致久治不愈。

4. 病毒负荷过高：病毒负荷过高可能导致治疗药物无法完全清除病毒，导致久治不愈。

5. 不良生活习惯：如频繁的性行为、不洁性行为、饮酒等不良生活习惯可能增加感染和复发的风险，导致久治不愈。

治疗生殖器疱疹需要综合考虑病毒负荷、免疫状态、病毒变异等因素，选择合适的治疗方案，包括抗病毒药物治疗、增强免疫、改变生活习惯等。同时，定期复诊、监测病毒负荷、与医生密切沟通也是治疗的重要环节。