阴茎根部长小痘痘可能是由于多种原因引起的。以下是一些可能的原因和建议：

1. 毛囊炎：阴茎根部的小痘痘可能是由于毛囊炎引起的。毛囊炎是一种常见的皮肤感染，通常由细菌感染引起。建议使用温和的皮肤清洁剂和抗生素药膏来治疗。

2. 疥疮：阴茎根部的小痘痘也可能是疥疮引起的。疥疮是一种由疥螨引起的皮肤感染，通常通过接触传播。建议使用抗疥药来治疗。

3. 毛囊角质化：阴茎根部的小痘痘也可能是毛囊角质化的结果。毛囊角质化是一种皮肤疾病，通常发生在皮肤较厚的部位，如臀部、腋窝和阴茎根部。建议使用温和的皮肤清洁剂和磨砂膏来治疗。

4. 局部感染：阴茎根部的小痘痘也可能是由于局部感染引起的。这可能包括细菌感染、病毒感染或真菌感染。建议使用抗生素药膏或抗真菌药膏来治疗。

如果你不确定病因，建议咨询医生进行诊断和治疗。同时，保持阴茎根部的清洁和卫生，避免使用刺激性的清洁剂和药物。