支原体肺炎是一种由支原体感染引起的肺部感染疾病。在支原体肺炎的后期，咳嗽可能是由于以下几个原因：

1. 气道炎症：支原体感染会导致气道炎症，这会刺激咳嗽反射。炎症会引起气道壁的肿胀和炎症细胞释放炎症介质，这些介质会刺激咳嗽反射。

2. 气道分泌物：支原体感染会导致气道内产生大量的分泌物，这些分泌物可能会刺激咳嗽反射。这些分泌物可能包括黏液、痰和脓液。

3. 气道痉挛：支原体感染可能会导致气道痉挛，这也是咳嗽的一个常见原因。气道痉挛会导致气道狭窄，使得气道内的分泌物更难以排出，从而刺激咳嗽反射。

4. 气道修复：支原体感染的后期，气道可能会进行修复。气道修复可能包括气道壁的修复和纤维化，这些修复过程可能会刺激咳嗽反射。

总的来说，支原体肺炎后期咳嗽的原因可能是气道炎症、气道分泌物、气道痉挛和气道修复。这些原因可能相互作用，导致咳嗽症状的持续存在。