胃肠功能紊乱是一种常见的消化系统疾病，治疗方法因人而异。以下是一些常用的药物治疗方法：

1. 抗酸剂：如碳酸氢钠、氢氧化铝等，用于中和胃酸，缓解胃灼热和胃痛。

2. 胃黏膜保护剂：如硫糖铝、枸橼酸铋钾等，用于保护胃黏膜，减轻胃黏膜炎症和溃疡。

3. 胃肠动力药：如多潘立酮、甲氧氯普胺等，用于促进胃肠蠕动，缓解胃肠胀气和便秘。

4. 抗生素：如克拉霉素、阿莫西林等，用于治疗感染性胃肠疾病，如肠炎、痢疾等。

5. 中药：如黄连、黄芩等，用于清热解毒，治疗胃肠炎症和溃疡。

然而，药物治疗只是胃肠功能紊乱治疗的一部分，还需要结合饮食调理、生活习惯调整等综合治疗方法。建议在医生的指导下进行治疗，避免自行用药。