习惯性流产（也称为复发性流产）是一种常见的妊娠并发症，其内在因素包括：

1. 遗传因素：某些遗传突变可能导致子宫内膜发育不良、胚胎发育异常等，从而导致习惯性流产。

2. 子宫结构异常：子宫结构异常，如子宫纵隔、子宫颈闭锁、子宫肌瘤等，可能影响子宫内膜的发育和胚胎的着床，导致习惯性流产。

3. 免疫因素：母体免疫系统异常可能导致胚胎排斥，从而导致习惯性流产。

4. 内分泌失调：黄体功能不足、高泌乳素血症、多囊卵巢综合征等，可能影响子宫内膜的发育和胚胎的着床，导致习惯性流产。

5. 感染因素：如细菌、病毒、弓形虫等感染，可能导致子宫内膜损伤、胚胎死亡，从而导致习惯性流产。

6. 药物因素：某些药物可能对胚胎发育产生不良影响，导致习惯性流产。

7. 心理因素：心理压力、焦虑、抑郁等心理因素可能影响妊娠过程，导致习惯性流产。

这些内在因素可能单独或综合存在，导致习惯性流产的发生。因此，在诊断和处理习惯性流产时，医生通常会综合考虑患者的病史、家族史、临床表现、实验室检查和影像学检查，以确定具体的内在因素，并制定相应的治疗方案。