近视眼手术中，半飞秒和全飞秒是两种常见的激光手术方式。它们之间的主要区别在于激光的输出方向。

半飞秒手术是将激光从角膜表面射入，使其产生大量的水晶体碎片，通过对角膜进行移除来达到矫正近视的目的。而全飞秒手术则是将激光从角膜表面射入，使其产生更多的水晶体碎片，通过对角膜进行移除来达到矫正近视的目的。

因此，这两种手术方式在治疗效果上有所不同。全飞秒手术可以更精确地控制激光输出，使其能够更准确地达到矫正近视的目的；而半飞秒手术则可以更容易地进行角膜移植等操作。

总之，选择哪种手术方式应该根据个人情况和医生建议来决定。