男性生殖器畸形检查通常包括以下几个方面：

1. 外观检查：医生会观察男性生殖器的形态是否正常，是否存在异常的曲线、隆起或凹陷等。

2. 阴茎长度测量：医生会测量男性阴茎的长度，以确定其是否过短或过长。

3. 龟头厚度测量：医生会用手指轻轻按压龟头，以测量其厚度。

4. 尿液检查：医生可能会进行尿液检查，以确定是否存在感染或其他疾病。

5. 血液检查：医生可能会进行血液检查，以确定是否存在任何异常情况。

6. 影像学检查：如果需要，医生可能会使用超声波、CT扫描等影像学技术来检查男性生殖器的结构和形态。

总之，男性生殖器畸形的检查通常是综合多种方法和技术进行的，以确保准确诊断和治疗。