卵巢畸胎瘤和卵巢囊肿是两种不同的疾病，它们的区别如下：

1. 形态特征：卵巢畸胎瘤是一种比较大的肿瘤，通常呈圆形或椭圆形，表面光滑，边缘清晰，没有穿孔或破裂。而卵巢囊肿则是一种小型的液体积聚物，通常呈圆形或椭圆形，表面光滑。

2. 发病机制：卵巢畸胎瘤是一种恶性肿瘤，会引起周围组织的浸润和破坏。而卵巢囊肿则是一种良性的液体积聚物，通常不会引起癌变。

3. 治疗方法：对于卵巢畸胎瘤，手术切除是最常见的治疗方法之一。对于卵巢囊肿，则可以通过观察、药物治疗等方式进行治疗。

总之，虽然两者都是卵巢疾病，但它们的发病机制、临床表现和治疗方法都有所不同。