扁平疣的皮疹表现是扁平的丘疹，多发在颜面、手背及前臂等部位，躯干也可发生，一般是皮色、褐色表现，搔抓后出现串珠样改变，即同形反应。而寻常疣又称为刺猴，是角化过度型的丘疹，圆形或者不规则型，数量可以单发也可以多发，皮疹大小多数大于扁平疣，临床上非常容易区别。寻常疣和扁平疣在病因，形状，好发部位及治疗方法等各方面均有所不同。

出现扁平疣，是由于病毒感染引起的，要注意保持局部清洁卫生，避免搔抓，防止扩散，可以使用抗病毒药治疗，如阿昔洛韦软膏，或者更昔洛韦软膏等药物，均匀涂抹在局部，如果扁平疣比较大，也可以采取激光治疗，效果比较明显，这种疾病一定要及早治疗，防止出现扩散，不要吃辛辣刺激性食物。例如常用的维A酸软膏，在使用的时候，只需要将少量的乳膏涂抹在患处，大部分的患者都可以收到比较理想的效果，常见的有5%咪喹莫特霜，氟尿嘧啶软膏等。治疗扁平疣如果上网搜或者是查书，发现有很多的药物可供选择，但真正有效的药物并不多。

对于扁平疣比较多的，可以用自体移植疗法，方法为消毒患处疣体，刮取两三个，在胳膊三角肌处种植，几天后大部分会发生反应，疣体比原来增多，随后几天所有疣体脱落。通过物理治疗的办法，比如冷冻、激光，还有外用治疗，提高自身的抵抗力，能够达到治愈的目的。一部分扁平疣可以自己好，一般在1到2年内可以自行消退，但也有相当一部分患者持续不退，患者有治疗需求。