在广义上卵巢囊肿也属于卵巢肿瘤的范畴，所以卵巢肿瘤与卵巢囊肿并没有什么区别。当发现盆腔出现附件区的囊肿或者肿瘤，需要做进一步的检查和诊断，以明确卵巢是否恶变等可能。但是狭义上一般卵巢囊肿属于良性的病变，而卵巢肿瘤可以是良性的病变，也可以是恶性的病变。

卵巢的恶性肿瘤，需要根据病理分型、是否有腹腔或者全身转移、病人体质状况等，采取手术、放疗、化疗、中医药或者综合方法等方式治疗。卵巢的良性肿瘤，如果直径小于3厘米，且身体没有出现其他异常，例如腹痛、腹水、经常发烧等，一般问题不大，可以不做处理，但是要定期的进行复查、随访；若是良性肿瘤体积较大，目前临床上主要以手术治疗为主，之后可以靠自身来恢复。卵巢肿瘤的治疗方法，需要根据卵巢肿瘤的性质来决定，例如是良性肿瘤或者恶性肿瘤。

对于卵巢囊肿直径小于5cm且没有合并不适主诉，查肿瘤标记物CA125、CA199、CEA、AFP等均在正常范围之内，对于此类患者可以于月经干净之后复查妇科彩超，根据妇科彩超的情况再决定下一步如何治疗。对于直径大于5cm的卵巢囊肿，且复查妇科彩超持续存在，这种情况建议可以选用手术治疗。手术治疗的方案包括腹腔镜和开腹手术，手术方式包括腹腔镜卵巢囊肿剥除术、腹腔镜患侧附件切除术、开腹卵巢囊肿剥除术、开腹附件切除术等。