人体依靠自已的免疫力去清除病毒, 是抗乙肝病毒的主要力量, 现有抗乙肝病毒药物起协助和促进作用, 所以抗病毒药的应用, 要抓住适当时机, 才能达到效果。 HBV感染可分为4个时期, 免疫耐受期、免疫清除期、非活动性HBsAg携带状态、少数患者可有再活动期。母婴传播和幼年感染HBV者, 免疫耐受期较长, 这期间HBV DNA水平很高, HBeAg阳性, 但ALT和AST长期在正常水平, 这期间应用现有抗病毒药治疗, 常不能取得预期的效果,  一般需到成年后才逐渐进入免疫清除期, ALT和AST逐步上升, HBV DNA为中等水平, HBeAg虽仍阳性, 如能测定量或相对定量, 比耐受期有所下降, 这是抗病毒治疗的最佳时期, 一般主张在无降酶药的影响下, ALT水平80 IU/L以上时, 抗病毒治疗效果较好, 但我国存在亚临床进行性慢乙肝临床现象, 要结合影像学检查和临床综合判断后进行抗病毒治疗。免疫清除期经过抗病毒治疗如有效, HBeAg从阳性转为阴性, 抗HBe阴性转为阳性, HBV DNA下降<105 cps/mL, ALT和AST复常, 进入非活动性HBsAg携带状态, 这是当前治疗的目标。 多数人可长期稳定在这期间, 少数患者可能进入再活动期, 它有两种情况, 一是由于病毒长期在免疫压力下, 病毒出现前C和C启动子变异, 逐步进入HBeAg阴性慢性乙肝, 二是HBeAg重新阳转, 这时ALT和AST上升, HBV DNA>105cps/mL, 又需要抗病毒治疗。所以对非活动性HBsAg携带状态者, 应在医生的长期监护下, 每半年复查肝功能、 HBV DNA定量、 AFP、 B超查肝脾情况, 以防万一。