药物治疗可以应用调节胃肠功能紊乱的药物以及抗焦虑，抗抑郁的药物来治疗，注意饮食清淡易消化，避免辛辣生冷刺激，过甜，过酸等不容易消化的食物，少食多餐，避免过饱饮食及暴饮暴食的情况，忌烟酒，浓茶，咖啡等等，保持心情愉悦，适当休息，避免过度焦虑与紧张，以及过度劳累与熬夜的情况。神经胃肠功能紊乱的主要表现是胃部不适、反酸水、烧心、打嗝、恶心、想吐等症状，特别是在吃了东西以后可以出现肚子胀、肚子痛、拉肚子、便秘等情况，甚至可以交替出现。肠胃神经功能紊乱，也就是功能性胃肠病。

如果出现严重的腹泻或呕吐，粪便中有血丝、黏液或脓，持续腹痛或哭闹或有持续高烧不退、活动力差甚至意识不清等状况，就必须立即就医，寻求医师的诊断与治疗。对症方面可以给保护胃肠黏膜的药物，像蒙脱石散，另外还可以给予口服调节肠道菌群的药物，像益生菌，有利于肠黏膜的修复。儿童肠胃炎发烧建议出现以后尽量到儿科门诊或者急诊进行相关处置，因为儿童的肠胃炎发烧跟成人不太一样。

神经性胃肠功能紊乱，就是胃肠神经官能症，由于多种精神因素，导致的胃肠功能紊乱，会出现上腹部隐隐作痛，伴有恶心，反酸、嗳气、腹胀、甚至呕吐，腹泻或者便秘。针对肠道功能紊乱的患者，临床上可能会出现反酸胀气，恶心厌食，上腹部不适，疼痛等症状，部分患者主要以肠道症状为主，有腹痛腹胀腹泻便秘等症状。神经性肠胃功能紊乱的主要表现，就是胃肠功能的紊乱、消化不好，比如说恶心、呕吐、反酸、嗳气，经常打嗝，甚至于放屁，就是排气。