卵巢囊肿和卵巢畸胎瘤是两种不同的疾病，它们之间存在一些区别。

首先，卵巢囊肿是指卵巢内形成的一种液体或半固体的肿块，通常是由于卵泡过多或者分泌物增多引起的。它们大多数情况下是良性的，并且可以通过手术切除来治疗。

而卵巢畸胎瘤则是一种较为罕见的肿瘤，通常是由于卵巢发育异常导致的。它们大多数情况下是恶性的，并且可能会引起不孕症、疼痛等症状。

其次，两种疾病的治疗方法也有所不同。对于卵巢囊肿，通常采用手术切除、药物治疗等方法进行治疗；而对于卵巢畸胎瘤，则需要根据具体情况进行手术、放疗、化疗等综合治疗。

总之，虽然两种疾病都涉及到卵巢问题，但是它们的治疗方法和预后都有所不同。如果您有任何健康问题或疑虑，请咨询专业医生进行诊断和治疗。