巧克力囊肿手术后需要注意以下几个问题：

1. 定期复查：手术后一般需要定期复查，以确保病情得到控制和恢复。建议每半年至一年进行一次复查。

2. 饮食调理：手术后应该避免辛辣、油腻等刺激性食物，同时要注意饮食营养均衡，多吃蔬菜水果。

3. 避免剧烈运动：手术后需要避免剧烈运动，以免影响伤口愈合和恢复。

4. 注意休息：手术后需要充足的休息，避免过度劳累和精神压力。

5. 定期检查：手术后还需要定期进行检查，以确保身体状况良好，并及时发现任何异常情况。

总之，巧克力囊肿手术后需要注意个人卫生、饮食调理、休息和定期检查等方面，以保证身体健康和恢复。