即使非常严重的骶管囊肿的症状，也就是下肢无力、大小便失禁、排便功能困难以及性功能障碍等等，只会影响生活质量，不会导致病人死亡。严重的骶管囊肿会对骶神经根形成一个压迫的症状，使病人出现骶尾部、会阴部以及肛门周围疼痛、麻木、酸胀以及后重等感觉。因此，即使是严重的骶管囊肿，也只会影响病人的生活质量，不会引起病人的死亡。严重的骶管囊肿还会压迫骨质，使骨质变得非常薄。

如果囊肿压迫到了周围的骨质神经，导致骨质破坏，运动感觉功能障碍，甚至大小便功能异常，那么这种情况就需要进行手术治疗。一般没有症状的囊肿，先不需要手术，可以进行定期的观察。骶管囊肿的手术一般需要在显微镜下进行。将囊肿壁修剪成型，然后用显微剪刀锐性的切除囊肿壁，不应该钝性的剥离，避免损伤神经根，不要强求完整切除囊壁。

骶管囊肿不良的症状，比如神经的疼痛、下肢或者会阴部感觉的障碍，可以口服相应的改善神经营养的相关治疗，比如口服甲钴胺加维生素B1进行治疗，可以有效的改善营养的相关状态。骶管囊肿暂时不能够通过药物进行治愈，因为还是一种器质性病变为主，但是对于骶管囊肿所引起的相应的症状，可以通过口服药物的方式进行改善，但是要想治愈骶管囊肿还是要通过外科手术的方式进行治疗。也可以口服一些止疼的药物进行处理，减少患者的痛苦，比如洛索洛芬、对乙酰氨基酚进行治疗。