对于诊断有困难，而有手术指征的病例，可以行手术剖腹探查，对病变肠段，切除后行病理组织检查，发现干酪样肉芽肿可获确诊。肠结核的诊断，通常需要首先通过结肠镜检查，如果发现回盲部的粘膜炎症溃疡，炎症的息肉，或者肠腔狭窄。同时，如果取活检组织送病理检查，找到干酪性的肉芽肿，具有确诊的意义。2~3个月后肠镜检查病变明显好转，可以做出肠结核的临床诊断。

小儿肺结核早期的症状：小儿肺结核早期症状是非特异性的表现，如精神不好，乏力，食欲差等，有的表现为轻微的咳嗽，可持续两周以上，出现面部潮红，发热，一般为低热，不超过三十八点五度，午后低热多见，夜间容易出现潮热、盗汗等症状，部分患儿可出现性格的改变，如烦躁不安，多动，坐立不安，精神萎靡，食欲不振，偏食，挑食等症状，久而久之就会出现营养不良，消瘦，抵抗力下降等。肺结核患儿要及早做PPD试验，痰检，肺CT检查，以明确诊断，及早的抗结核治疗，痰检阳性的，要注意隔离，避免交叉传染给他人。

结核分枝杆菌主要通过继发性肺结核的患者在打喷嚏、咳嗽、大笑、大声说话的时候，把含有细菌的飞沫排到空气中，其他人通过呼吸道吸入而造成传染。结核病的传染源主要是一些继发性肺结核的患者，导致结核病的细菌是结核分枝杆菌，这个细菌主要随着患者的痰排到体外而进行播散，在痰里面能找出结核分枝杆菌的患者才具有传染性，是传染源，传染性的大小取决于痰里含有细菌量的多少。结核病的传播途径主要通过呼吸道的飞沫传播，另外，还可以通过消化道和皮肤等途径传播，但已经非常少见。