具有持续或反复发作腹泻和粘液脓血便，腹痛，里急后重，伴有或不伴有不同程度全身症状者，在排除慢性细菌性痢疾，阿米巴痢疾，慢性血吸虫病，肠结核等感染性结肠炎及结肠克罗恩病，缺血性肠炎，放射性肠炎等基础上，具有上述结肠镜检查中要改变中至少一项及粘膜活检组织学所见可以诊断本病。初发病例及临床表现、结肠镜改变不典型者暂不作出诊断，需随访3~6个月，根据病情变化再作出诊断。本病组织病理无特异性，各种病因均可以引起类似的肠道炎症改变，故只有在认真排除各种可能有关的病因后，才能作出本病诊断。一个完整的诊断应包括临床类型，临床严重程度，病变范围，病情分期及并发症。

像一般情况下对于慢性结肠炎的治疗以药物治疗和手术治疗为主，像药物治疗方面主要有抗感染药物，通过药敏实验和细菌培养选择合适的抗感染治疗，另外像止泻药物，胃肠道解痉药物以及缓解腹胀的药物对于慢性结肠炎都是比较有效果的。其具体的治疗应当在医生的指导下进行，这样才能够有效的缓解患者的病情，取得比较好的治疗效果。因为慢性结肠炎的病因比较多，不同病因导致慢性结肠炎的发病情况也不一样，因此针对慢性结肠炎应当采取不同的药物进行治疗，尤其要对其病因进行对症治疗。

进食的食物应该细、软，便于咀嚼和吞咽，最好能够少食多餐，注意不要吃葱、姜、蒜等食物，也不要喝酒。也可以吃瘦肉、牛羊肉、面包、淀粉类、水果、蔬菜等食物，多喝点鲜榨果汁；可以多吃小米粥、八宝粥、红豆粥等营养的粥类食物和清淡的汤；溃疡性结肠炎患者应该进食一些低脂肪、高蛋白、高热量、低纤维素的食物。