一般治疗，小儿百日咳是传染病，需要隔离，要保持室内安静，空气流通，温度适当，避免诱发小儿痉挛性咳嗽，要多给容易消化的食物，补充多种维生素和钙剂。对症治疗，主要就是要镇咳、化痰，也可以用雾化吸入等，必要时要给予镇静剂，减少小儿恐惧、忧虑、烦躁而诱发的痉挛性咳嗽。小儿百日咳主要以抗菌药物治疗为主，一般治疗、对症治疗和针对并发症治疗为辅。并发症治疗，如果出现支气管肺炎、肺不张、肺气肿、百日咳脑病等，需要尽早住院治疗，以免危及生命。

通常情况下百日咳恢复期的患者，并不需要使用药物治疗，主要是需要注意日常生活方面的护理。百日咳恢复期，通常患者的阵发性痉挛性的咳嗽会逐渐减少到停止，鸡鸣样的吼声也会消失。百日咳的恢复期通常一般为2到3周，如果有并发症，会适当的延长，可以达数月。饮食方面需要注意清淡饮食，多吃一些新鲜的水果蔬菜，多饮水。

初期的表现和普通的感冒症状营养会出现流鼻涕、打喷嚏、咽喉部干痒、刺激性咳嗽等症状，典型的咳嗽症状就是阵发性的痉挛性咳嗽，还会出现犬吠样的咳鸣音，有的患者还会出现吸气样的鸡鸣音， 应该进行分泌物常规检查或者是进行其他的相应辅助检查确诊。百日咳这一种呼吸道传染性疾病，潜伏期约为七到十四天左右，多数是接触的患者或者是感染了白喉杆菌、百日咳杆菌感染所致。