消化系统寄生虫疾病，例如钩虫病、痨虫病、血吸虫病，也可能会出现胃肠炎的不适表现症状，此时可以进行粪便培养、血常规检查，能够在诊断，另外就是外性淋巴瘤或者胃肠道内的恶性肿瘤，也需要进行鉴别诊断，这种情况需要借助内镜进行活检来判断。急性胃肠炎的鉴别诊断主要是对急性胃炎和急性肠炎进行鉴别，急性胃炎的患者通常主要表现为有异常的上腹疼痛主要考虑可能是吃了一些刺激性的食物导致出现的表现，通常没有明显的腹泻的症状。另外，炎症性肠病，比如说，克隆氏病或者溃疡性结肠炎，也会出现腹痛、腹泻症状，可以通过肠镜可以明确诊断。

胃肠炎一般以急性的胃肠炎比较多见，由于饮食不当，吃了没有洗干净的水果、蔬菜及剩饭等都会引起，可以表现为腹痛，恶心，呕吐，腹泻症状，如果感染比较重的还会引起发烧、电解质紊乱等。目前引起嗜酸细胞性胃肠炎的原因尚不明确，可能是由于对食物或者是药物过敏、身体免疫功能障碍等原因导致。胃肠炎不难治。

如果有腹痛，恶心，呕吐，泛酸，食欲不振，消化不良，需要到消化内科进行电子胃镜检查，幽门螺旋杆菌检查明确诊断，选用药物进行治疗。如果存在胃部疾病，医生一般建议进行胃镜、钡餐造影以及C14呼气试验等检查。肠胃检查应该去医院的消化内科就诊。