比较少见导致脑膜炎的细菌有埃希大肠杆菌和克雷伯杆菌，细菌感染可以发生在头颅损伤脑和脊髓手术后，广泛的血液系统感染或者医源性感染的基础上，免疫功能紊乱的患者更容易感染。80%的细菌性脑膜炎由以下三类细菌感染所致，脑膜炎奈瑟菌，流感嗜血杆菌，肺炎链球菌，正常情况下这些细菌广泛存在于外界环境中，并且可寄生在人体鼻和呼吸道内而不产生危害。偶尔这些病原均可以在没有明确诱因的条件下感染中枢神经系统，脑膜炎也可由头颅穿通伤和自身免疫系统异常所致。细菌性脑膜炎较容易发生在脾切除术后，慢性耳和鼻感染患者以及肺炎球菌肺炎，和镰状细胞贫血的患者。

病毒性脑膜炎属于神经内科的常见疾病、多发疾病，这种疾病一般是因为各种病毒影响脑膜，从而造成的颅内神经系统的感染，患者最常见的临床表现是发烧、头疼、恶心、呕吐的表现，也有些病人会有明显的颅内高压，出现严重的头疼和恶心呕吐，病毒性脑膜炎一般预后良好，通常是有一些疱疹病毒、呼吸道的病毒以及肠道病毒等引起的，预后较好，一般情况下给予抗病毒药物进行治疗，就会获得良好的效果，必要的时候可以行腰椎穿刺化验，分离病毒核酸或进行相关病毒抗体的检测，明确哪种病毒以后，再进行针对性的治疗效果会更好一些，通常情况下，病毒性炎症要及早治疗，尽早的给予抗病毒的药物，并且给予相应的一些对症处理的药物预后相对比较良好，能治好。

前者是以大肠杆菌最多见，致病菌可通过多种途径侵入脑膜，最常见的途径是通过血流及菌血症抵达脑膜微血管，当小儿免疫防御功能降低时细菌穿过血脑屏障到达脑膜。两个月以下的婴幼儿和新生儿以及原发和继发性的免疫缺陷病者，易发生肠道革兰阴性杆菌和金黄色葡萄球菌脑膜炎。临近组织器官感染中耳炎，乳突炎等扩散可以波及脑膜，如颅骨骨折皮肤都到细菌可因此直接进入触网膜下腔。许多的化脓性都能引起本病，但三分之二以上患儿是由脑膜炎球菌，肺炎链球菌和流感嗜血杆菌三种细菌引起。