确诊结肠炎，可以通过结肠镜检查，直视肠腔黏膜，有时还可以见到黏膜血管纹理模糊、紊乱，充血水肿，脆性增加，容易出血，有脓性分泌物附着，还可以见到黏膜粗糙，呈细颗粒状。确诊结肠炎，可以通过临床表现以及辅助检查，患者通常表现为腹泻，有时还会出现黏液脓血便，有的结肠炎患者会出现腹部疼痛，一般诉有轻度至中度的腹痛，多位于左下腹或下腹部，通常有疼痛-便意-便后缓解的规律。病变明显处可以见到弥漫性多发糜烂或者溃疡，慢性结肠炎还可以见到结肠袋囊变浅、变钝或消失，有时还可以见到假息肉及桥形黏膜等。通过肠镜可以确诊结肠炎，还可以通过病理组织学检查，明确病变的性质。

还有慢性持续型，症状持续，间断血便和腹痛等症状，其间可有急性发作，急性发作时症状严重，需进行手术。可有腹胀、食欲缺乏、恶心、呕吐等症状，还有可能发热并伴有肠道外疾病和肝损害、关节炎、皮肤损害、心肌病变、口腔溃疡、巩膜外层炎及内分泌病症。临床上最常见的为慢性复发型，发作期和缓解期相交替。而急性型常病情严重，全身毒血症状明显，还有可能伴有中毒性巨结肠。

一般肛门直肠炎的症状表现为便血，大便带血或排粘液样便，还有肛门周围疼痛，还有就是排便习惯改变，比如腹痛、便秘、腹泻。有的患者还有发热、食欲不振、恶心、呕吐、里急后重等症状，个别患者因为消化不良、长期的恶病质、营养不良会导致体型消瘦，有的患者有肛门灼痛等症状。由于病因不同，它的临床表现也不尽相同。肛门直肠炎，有的直肠炎，包括直肠黏膜损伤、感染以后出现的直肠炎。