肠胃炎的诊断要依靠病史，主要表现为上腹部饱胀、恶心、呕吐，呕吐物为胃内容，伴有腹痛、腹泻，一般情况下解稀糊状大便或者水样大便，有时伴有发热、乏力等表现。如果病情持续加重，可以通过检查血常规，大便常规，大便培养等明确具体的致病菌群，反复出现胃肠炎者与肠易激综合征，克罗恩病等疾病密切相关。若伴有胃炎，则可进行胃镜及胃黏膜活组织检查，是最可靠的诊断方法，通过胃镜在直视下观察黏膜病损。

怀疑严重脱水的病人，应该注意监测电解质及肾功能，病源接触史是重要的诊断特征，可以通过患者叙述的使用食物和饮用水的经历，以及通过血液、呕吐物、粪便培养来进行检查。肠胃炎做粪便检查可以大致明确引起肠胃炎的原因，做粪便检查一般需要先观察大便的颜色、大便的形状，并且有可能需要做粪便细胞的检查以及隐血试验的检查，少部分患者可能需要做大便的培养以及药敏试验。慢性肠炎的检查主要是查血常规、大便常规、大便培养以及肠镜的检查，同时结合患者的不适症状，基本可以确诊。

由于肠胃在人体的主要功能是消化和吸收食物的，所以如果肠胃出现病变，首先要就诊消化内科来进行初步的检查和治疗。通过简单病史的询问及症状体征的采集之后确定治疗的临床诊断，再通过胃镜、上消化道造影等进行检查，部分患者还需要行碳13呼气试验来明确是否有幽门螺杆菌感染。肠胃不舒服挂消化内科。