南京市有很多医院可以提供不孕不育的检查和治疗服务，但是选择哪家医院最好需要根据个人情况和需求来决定。以下是一些南京市比较知名的不孕不育诊疗机构：

1. 南京中山医院：该医院是国家临床重点专科，设有不孕不育科，提供各种不孕不育诊疗服务。

2. 南京鼓楼医院：该医院也有专门的妇产科，提供各种妇科疾病和不孕不育诊疗服务。

3. 南京市妇幼保健院：该医院也是一家综合性的医疗机构，提供各种妇产科、生殖保健等服务。

4. 南京市第一人民医院：该医院也是一家综合性的医疗机构，设有不孕不育科，提供各种诊疗服务。

当然，这只是其中几家较为知名的医院，您可以根据自己的实际情况和需求进行选择。建议您在就诊前先了解相关信息并咨询专业医生的意见。