大多数患者在治疗之后，5年的生存率可以达到60~80%左右，一般只要患者及时治疗，规范治疗，并没有出现肾功能的不全，并没有使消化系统以及心脏受累。只有极少数患者出现有严重的心肌、胃肠道的受累，以及出现有蛋白尿和哮喘、血管炎发病间隔时间比较短的情况下，愈后不良，不容易治疗彻底，甚至导致死亡。肺曲霉菌感染大多数患者及早的发现，是能够完全治疗好转的。一般患者通过早期的诊断，及时的规范治疗，愈后都比较好。

支气管扩张的患者由于免疫力低下，容易导致肺部的反复感染而加重咳嗽、咳痰、咯血的症状，肺部后面的感染也是如此，对于这类支气管扩张合并感染的患者要积极的控制感染，可以根据患者的痰细菌培养及药敏试验结果选择敏感的抗生素进行治疗，可以选择广谱的头孢菌素、青霉素、喹诺酮、氨基糖苷类抗生素，同时积极的对症治疗，可以选择氨溴索、溴己新等药物止咳祛痰，如果患者咯血可以使用止血芳酸、缩宫素、垂体后叶素等药物进行止血治疗。建议病人卧床休息，保持大便通畅，不要吃过热的食物。

肺部真菌感染，病情还是比较严重，要积极地进行治疗，否则会导致败血症、呼吸衰竭、感染性休克，甚至死亡的发生。要根据痰培养药敏的结果，针对性的使用抗真菌药物。如果血糖异常增高，要用胰岛素控制好血糖，加强对症支持处理。如果患者有肺部感染，还需要积极的抗炎抗感染治疗。