对于一些不能完全治愈的慢性骨髓炎，可以进行控制及临床病征，其一般不会影响患者的生命。慢性骨髓炎，通过对局部病灶清除，进行死骨的拆除以及大量维生素进行的应用，其部分可以治愈。慢性骨髓炎常常是由于急性骨髓炎治疗失当所导致的，另外有一些开放性创伤，也可以导致慢性骨髓炎。

对急性高度可疑为血源性骨髓炎的病例，在获得血缘标本后立即开始经验用药，如果病变部位有脓液生成，早期开窗减压可根据获得标本图片的格兰染色，初步选择抗生素，用药方式通常为静脉给药，对于儿童患者在充分合作以及敏感抗生素的基础上可采用静脉加口服给药，用药时间通常为四到六周。慢性骨髓炎，不推荐经验用药，尽量在彻底手术清创并在获得术中标准培养结果的基础上，进行针对性抗生素治疗，如未能获得培养结果可联合使用对金黄色葡萄球菌尤其是甲氧西林耐药金黄色葡萄球菌mrsa和革兰阴性杆菌有效药物。通常根据不同类型骨髓炎最常见的致病菌种类或脓液涂片，格兰染色结果初步选用合适的抗生素。

必要时需要进行手术治疗，手术的目的就是引流脓液，减少毒血症症状，阻止急性骨髓炎，转变为慢性骨髓炎，手术治疗越早越好。等待细菌检查结果出来以后，可以选择敏感的抗菌药物进行治疗，即时全身消退后，也需要进行一段时间的抗菌药物治疗。在早期就立即开始，足量应用抗生素治疗，可以选择广谱抗生素，也可以进行联合应用。可以进行钻孔引流和开窗减压，必要时可以应用，抗生素进行灌洗引流。