幽门螺杆菌的治疗主要就是选择应用一些抗菌药物，例如克拉霉素或者是阿莫西林，或者是应用一些甲硝唑、替硝唑等一种或者两种抗菌药物，同时需要结合应用兰索拉唑、奥美拉唑等进行治疗，配合应用一些胶体铋剂共同进行调理，才可以起到杀除幽门螺杆菌的作用。至少要连续应用两周左右的时间，而且也需要定期进行复查，因为幽门螺杆菌的再生能力是比较强的，很容易出现有病情的再发，所以需要再次进行治疗。杀除幽门螺杆菌，这样就可以减少胃部出现有恶变发生的几率性。

其实每个人出生的时候母亲就将益生菌传给每个人，成长过程中，益生菌在胃肠道的营养调节作用至关重要，它会伴随一生，但是由于生活环境，食品污染，生活作息不规律以及抗生素滥用等问题导致体内益生菌越来越少，体内有益菌的减少微生态环境遭到破坏后就造成了各种疾病的发生，通过补充有益菌平衡微生态环境，让保持健康是很有必要的，比如卫舒元益生菌，正是以纯正双西杆菌为代表的活性菌株复合作用，利用自身绝对的优势由益菌来排挤掉幽门螺旋杆菌，从而使胃肠道生态环境保持平衡，身体保持健康。​即中药杀菌西药杀菌之后，又出现了益生菌杀菌这样的新型的杀菌方法，近几年益生菌杀菌早已不是什么新鲜的事儿，可是有一部分的人对益生菌能否杀灭幽门螺旋杆菌，仍然是非常怀疑，健康的生命之所以能够延续是由于人体肠道内有正常的新陈代谢。

如果说是幽门螺杆菌阳性，而且消化道的症状比较明显，这种情况就需要根除幽门螺杆菌。这种情况幽门螺杆菌的根除率大于80%以上，没有明显的副作用，病人的耐受性也比较好。幽门螺杆菌感染，在临床上有可能表现为反酸、烧心、胃痛、口臭，另外有可能会出现上腹部不适，隐痛。一般情况下对于耐药性的比较少，有些抗生素的话比如说青霉素，甲硝唑，克拉霉素，强力霉素都能够起到很好的治疗幽门螺杆菌的作用。