半夜起来上厕所心脏跳的厉害可能是心律失常或者是心脏供血不足引起的，也有可能是生理性因素导致的。

1、心律失常：心律失常会出现心脏跳动的频率加快或者节律有异常，病情不是特别严重的情况下，会出现头晕、心脏跳的厉害，严重的情况下有可能会出现猝死、昏厥。

2、心脏供血不足：心脏供血不足可能是甲状腺功能出现异常导致的，也有可能是心绞痛、冠心病引起的，一般会出现心脏跳的厉害、呕吐、恶心、头晕等症状。

3、生理性因素：比如经常喝酒、咖啡、浓茶，情绪过于激动、运动等，都有可能会出现心脏跳的厉害。

如果经常出现半夜起来上厕所，心脏跳的厉害，建议最好到当地正规的医院做动态心电图检查或者颅内CT检查，明确病因可以在医生指导下做出针对性的治疗，以免导致病情加重。在平时生活中可以多吃一些营养丰富的食物，比如鸡蛋、牛奶、瘦肉、动物的肝脏等，不要吃太油腻、太咸的食物，比如肥肉、咸菜等，要适当的做些体育锻炼，注意休息，不要过度劳累。