卵巢巧克力囊肿的病因最主要的是经血逆流，月经期间，子宫内膜组织随经血逆流入输卵管，从输卵管腹腔开口进入盆腔内，种植在卵巢上，并在卵巢上继续生长和蔓延。还有一些是淋巴及静脉的播散，或者免疫与炎症的因素，还有一些是遗传因素，或者其他的一些因素。卵巢巧克力囊肿是一种良性病变，但是具有种植、侵袭、远处转移的特点，而且存在一定的恶变率。

卵巢巧克力囊肿是比较严重的，这是由于子宫内膜异位到卵巢而形成的疾病，种疾病，主要的症状表现为进行性加重的痛经，也就是每次来月经，都要比前一次腹痛严重，而且这种疾病有可能破坏卵巢的正常组织结构，影响排卵，就会影响怀孕，甚至造成不孕，而且随着疾病的发展，有可能导致盆腔粘连，使输卵管粘连甚至堵塞，会导致受孕率下降，或者不孕，如果卵巢囊肿逐渐增大，出现破裂，就会导致急剧的腹痛，腹腔内出血，甚至休克的，非常危险。需要急诊手术治愈。

我们常规做妇科检查，巧克力囊肿这部分病人因为每次来月经都会在囊肿周围形成粘连，这部分病人的囊肿是比较固定的，甚至有些人阴道检查的时候，她有一个痛点，而单纯性囊肿她基本上没有太明显的粘连或者疼痛的产生。有一部分病人表现为痛经、不孕、同房痛、腹痛，没有症状的时候她可能不来检查，有症状了来做个B超，发现有一个囊肿，和普通的单纯的卵巢囊肿的区别在于哪儿呢？另外，这部分人痛经是比较明显的，而单纯性囊肿可能没有任何症状，不痛，也不痒，什么症状都没有，只是说常规体检做B超才发现的。开始可能只是一个子宫内膜异位病病灶，随着时间的延长，每次月经的来潮慢慢的形成了囊肿，慢慢的长大。