新生儿脸上起透明的小水泡考虑与湿疹、虫咬性皮炎以及水痘疾病有关，需明确疾病类型和遵医嘱治疗。

1、湿疹：多考虑是因为受潮、过敏、接触化学物质等多种因素的刺激导致新生儿皮肤上出现的一种特异性皮炎症状。发病期间都会伴随有不同瘙痒症状，建议确诊后遵医嘱使用炉甘石洗剂、氧化锌软膏或氯雷他定糖浆等药物进行治疗。

2、虫咬性皮炎：多考虑是因为蚊虫叮咬人体后，当蚊虫分泌物中的活性物质刺激人体免疫系统引发的过敏性反应。发病期间体检可发现大小不同的咬痕伴随有瘙痒症状。治疗方面可遵医嘱使用丁酸氢化可的松乳膏、硼酸氧化锌冰片乳膏以及盐酸西替利嗪滴剂等药物进行治疗。

3、水痘：是一种因水痘-带状病毒感染而引发的皮肤疱疹性疾病。发病期间患儿还可出现斑疹、丘疹以及发热等症状。治疗方面需遵医嘱使用炉甘石洗剂、阿昔洛韦软膏、静注人免疫球蛋白等药物进行治疗。

除上述疾病以外，还可考虑与真菌感染、痤疮等疾病有关。