了解有没有凝血障碍以及是否应用抗凝药物，有无药物过敏以及慢性的传染性疾病，如果怀疑此类疾病，需要进行相关的实验室检查，判断有无结肠镜检查的适应症以及禁忌症。在检查前，签署知情同意书，由于结肠镜检查和治疗存在一系列的并发症，因此要向患者说明检查的目的和可能出现的问题，征询及同意并签署知情同意书，交代注意事项以及配合检查时的体位。在检查前，要注意一到两个小时进低脂、稀软、少渣的半流质饮食，严重便秘的应该在检查前3小时给予缓泻剂或者助动力药物排除结肠内潴留的大便。​术前应充分了解病情，包括详细的病史、体格检查、生化检查以及钡剂、灌肠等影像学资料。

如果是无痛肠镜检查，拿了申请单到麻醉科医生处开麻醉单，再一起交费，再到检查预约中心预约做检查的时间。在肠镜检查前的一天下午四点要吃两粒便塞停，再将两包和爽药粉用2000毫升的水混合均匀，分两次分别在晚上九点和11点左右各口服1000毫升。如果是普通肠镜检查，交费之后直接到检查预约中心预约检查时间。肠镜检查的前一天要吃一天白粥，可以吃点鱼跟鸡蛋，不能吃青菜，水果及其他肉类。

为了保证较好的肠道准备，肠镜检查前一天，建议患者吃比较少渣的或者流质的食物，这样在吃泻药以后，大便比较容易排出来，比如可以进食白粥或者面条等比较细软、少渣的食物。粗纤维的或者是水果，尤其是像火龙果等带籽的水果，还有蔬菜、肉类这些食物食用以后不容易消化，不容易完全排出体外，进食这样的食物会影响第二天的肠镜检查的结果。因此，水果、蔬菜、肉类等不易消化和高纤维的食物，在肠镜检查的前一天尽量不要吃。